船仓库系统是无尽的拉格朗日中管理舰队资源与舰船配置的核心模块，其设计围绕资源整合与战术调度展开。该系统采用独立仓储空间机制，将工程舰与战斗舰的存储容量分开计算，避免资源采集与军事行动相互干扰。工程舰仓库专注于矿石、晶体等资源的临时存放，通过搭载重型运载驱逐舰（如AC721）可扩容单次采集量；战斗舰仓库则用于维护武器模块、技术蓝图等战略物资，支持舰船强化与改装需求。两类仓库均受基地等级限制，需通过升级港口或指挥中心提升容量上限。
仓库管理界面采用模块化布局，左侧为舰船列表，按护卫舰、驱逐舰等类型分类，右侧显示当前选中舰船的属性与仓储状态。玩家可通过分解多余舰船获取稀有资源，用于精炼现有舰船或解锁新蓝图。舰队增援功能会暂时占用仓库空间，若未预留足够容量可能导致增援失败。仓储升级资源优先分配给金属与晶体，因这两种材料在舰船生产与建筑升级中消耗量最大，重氢则主要用于后期高级舰船制造。
工程舰仓库设计强调效率优化，其核心在于缩短资源往返时间。小型工程舰初期需搭配仓储强化技术点，优先提升单次采集量而非速度；中型以上工程舰则需平衡移动速度与仓储容量，通常采用1工程舰+1运输舰的编组模式。采矿平台可间接扩展仓库功能，允许两艘工程舰同时作业于同一资源点，并免除返航上交步骤。战斗舰仓库则侧重战术扩展性，通过模块插槽实现武器、护甲等组件的快速更换，但每次改装会清空该舰原有仓储内容。
仓库安全机制通过前哨站实现间接防护。对接资源带后，基地仓库可直接吸收资源点产量，但会永久关闭该点的工程舰采集权限，此操作需谨慎评估长期收益。未被保护的野外仓库易成为攻击目标，建议将重要物资存放于基地核心仓库或同盟共享空间站。后期可通过高级采矿平台实现矿区自动化防御，但需消耗大量电子货币维护。仓库与舰队指挥系统深度联动，超出指挥值的舰船无法从仓库部署，需通过科研提升舰队规模或精简舰船配置。
船仓库的底层逻辑体现为资源流与信息流的双重管控。资源流控制包括采集、存储、消耗的闭环循环，信息流则涵盖蓝图研究进度、舰船技术值分配等数据整合。玩家需定期清理冗余物资，避免仓库堵塞影响战略机动性。该系统通过限制单个资源点的采集权限，促使玩家建立分布式仓储网络，最终形成以基地为核心、前哨站为节点、采矿平台为补充的三级仓储体系，支撑星系级作战的物资需求。
