模块系统是无尽的拉格朗日核心玩法之一，通过装配不同模块可以显著改变舰船的战斗定位和战术价值。模块分为武器、防御和特殊三大类，武器模块直接影响舰船的输出能力和攻击方式，防御模块提升生存能力，特殊模块则提供资源采集、电子战等独特功能。合理搭配模块能弥补舰船短板或强化优势，例如为航母装配大型载机系统可大幅提升战机搭载量，而电磁装甲模块能有效抵抗能量武器伤害。模块的获取依赖蓝图研究或资源交易，需要根据战术需求优先选择关键模块。
模块装配并非一成不变，需根据战场环境动态调整。面对高护甲目标时，装配穿甲武器模块比标准火力模块更有效；在资源匮乏区域，搭载采矿增效模块的工程船能更快积累资源。同类模块存在性能差异，例如脉冲炮塔阵列相比基础火炮模块具有能量伤害特性，对特定舰种有额外克制效果。模块强化消耗的技术值需谨慎分配，优先提升核心模块的关键属性，如航母的载机容量或战列舰的主炮冷却效率。
搭载反舰导弹的驱逐舰需要配备防空模块的护卫舰保护，而装配电子干扰模块的巡洋舰能为主力舰队创造输出窗口。特殊模块如护航艇搭载系统能扩展舰船功能，使战列巡洋舰兼具航空战力。在联盟作战中，模块搭配还需考虑团队互补，例如部分玩家专注装配资源模块维持后勤，其他成员则强化战斗模块形成专业分工。
模块系统的深度定制带来显著的策略维度扩展，但也存在资源分配矛盾。高级模块需要消耗大量研究点数，可能导致舰船发展不均衡。建议初期集中强化2-3艘主力舰的模块体系，而非分散投入所有舰船。模块组合的试错成本较高，可通过模拟战斗或小规模冲突验证效果，避免在关键战役中出现模块性能误判。随着游戏进程，模块库的积累将逐步解锁更多战术可能性。
