隐藏任务的设计往往与主线剧情关联不大，但能为玩家提供额外的探索乐趣和成就解锁。这些任务通常需要玩家通过细致的观察、与NPC的互动或特定道具的组合才能触发。金字塔门口右侧裂开的墙内藏有STAFF符号，与游戏首页左侧的密码对应，输入正确密码后可解锁隐藏内容。神庙密室墙上的8个圆盘互动时，点击小人还会触发惊喜效果。隐藏任务的线索通常分散在游戏场景的细节中，需要玩家耐心收集和推理。
反复出入船舱时，小女孩的玩偶有几率刷新为南瓜先生或小三角，点击它们可分别解锁南瓜先生大冒险和小三角大英雄成就。完成前两个成就后，二周目通关时火箭升空至宇宙场景需等待约3分50秒，直到BGM播放至第三遍，火箭会降落到神秘地点并解锁宇宙的尘埃成就。这类隐藏内容不直接提示，需玩家主动尝试或长时间等待才能发现。
工厂铁箱的开启需参考神庙密室壁画的提示，壁画中睁开的眼睛对应铁箱密码的第3、5、7、8位。而金字塔密室的华容道谜题解法需结合场景中的其他线索，如神秘雕像处的图案与神庙密室密码的关联。这类任务要求玩家综合已有信息，甚至跨场景推理，充分体现了解谜游戏的核心玩法。
隐藏任务的完成还可能影响游戏结局或解锁特殊剧情。二周目中，收集六个三角形石块并按灯塔二层的分布图摆放，可开启神庙密室。密室内壁画的密码需通过金字塔门口缝隙中的游戏感谢名单图案推导，最终输入4325长度的铁棒密码即可完成终极隐藏挑战。这些设计不仅增加了游戏的可玩性，也让玩家在反复探索中更深入地理解游戏世界观。
迷失岛的隐藏任务需要玩家保持敏锐的观察力，合理利用道具，并勇于尝试非常规操作。尽管部分任务难度较高，但成功解锁后的成就感和剧情补充足以弥补前期的探索成本。建议玩家在遇到卡关时，优先回顾已收集的线索，或暂时搁置以触发后续剧情。
