无尽的拉格朗日剧情主线围绕人类星际扩张与文明兴衰展开，核心矛盾聚焦于拉格朗日系统的发现、应用及其引发的星际权力争夺。故事始于人类突破太阳系限制的科技飞跃——可控核聚变与曲率引擎的诞生，使跨星系航行成为可能。而拉格朗日空间共振点的发现彻底改变了文明格局，这种连接数千光年外的空间节点被改造成星门，最终形成覆盖银河系三分之一的拉格朗日网络。这一阶段剧情着重展现科技突破带来的开拓精神，玩家作为势力领袖将体验从零开始建立太空站、组建舰队的初期发展历程。
随着剧情推进，拉格朗日系统逐渐成为各方势力博弈的焦点。星际势力为争夺星门控制权爆发大规模冲突，战争导致原本辉煌的交通网络分崩离析，人类进入科技衰退的黑暗时代。游戏通过任务文本与场景设计隐晦呈现这段历史，例如废弃星门遗迹和战争残骸的探索任务。主线中玩家需要面对资源短缺、技术断层等挑战，同时通过研究蓝图逐步重建舰船科技树，这一过程巧妙呼应了文明复兴的主题。剧情特别强调势力间的合作与竞争关系，外交策略的选择直接影响故事分支走向。
中期主线围绕开拓与回归的哲学命题展开。玩家需抉择是否继续开发未知星系，或重返地球恢复母星文明。这一阶段任务涉及建立同盟疆域、探索黑暗森林法则下的未知星域，以及与其他势力进行资源贸易或军事对抗。剧情通过动态事件系统展现星际社会的复杂性，例如突发的外交危机或技术泄露事件。主线并非线性推进，而是通过协议选择机制形成网状叙事结构，不同协议会解锁独特的剧情任务链。
后期剧情深入探讨星际文明的存续问题。随着玩家势力扩张，将接触到被称为帝国遗产的远古科技，这些遗迹隐藏着关于拉格朗日系统起源的线索。最终章节任务需要协调多方势力重建星门网络，或选择独占技术成为新霸权。游戏通过舰船日志、科研档案等碎片化叙事手段，逐步揭示上古战争真相与拉格朗日节点的潜在危险。整个主线在保持科幻硬核设定的同时，始终将叙事焦点放在人类面对宇宙尺度挑战时的集体行为与个体抉择上。
